岭南通和羊城通的主要区别如下：
使用范围不同：
岭南通：是广东省统一的交通智能卡系统，可在广东省内的多个城市使用，包括但不限于广州、佛山、汕尾、肇庆、江门等地。
羊城通：主要适用于广州市的公交车电子收费系统，是广州市城市交通智能化系统工程的相关子系统，主要用于广州市内的公共交通支付。
发行时间不同：
岭南通：首批亚运岭南通卡于2010年11月8日发行，标志着岭南通系统的正式启用。
羊城通：早在2001年12月30日，羊城通便开始在广州市的22、107、270三条公交线路试用，并发行了普通储值卡。
主管公司不同：
岭南通：由广东岭南通股份有限公司管理，该公司是在广东省委省政府督办和广东省交通运输厅具体部署下，由多家企业合作成立的，旨在推进全省公交一卡通工作。
羊城通：由广州羊城通有限公司管理，该公司是直属广州市公共交通集团有限公司的国有法人独资企业，专注于广州市内的公共交通电子收费业务。
