南珩的悲惨遭遇主要体现在多个方面。
首先，在宫廷地位上，南珩作为皇子并未得到应有的尊重和地位。他的父亲靖王对他态度冷淡甚至厌恶，从小就被扔到冷宫，长大后更是被派往危险的边疆去打仗。他立下赫赫战功，但回到京城迎接他的却是百姓的唾骂和垃圾，被冠以“杀神”的恶名，这对他来说无疑是一种极大的侮辱和伤害。
其次，在亲情方面，南珩也备受打击。他的同父异母弟弟南瑞，虽然表面看似傻乎乎，但实际上一直在与南珩敌对，甚至为了争夺皇位和保护自己的势力，不惜算计南珩。而他的舅舅高相，表面上是他的助力，实际上却在暗中操控一切，试图掌控南珩，甚至在发现南珩爱上宋一梦后，竟然想要除掉宋一梦，这种亲情的背叛和伤害让南珩更加痛苦。
再者，在友情和爱情方面，南珩也经历了背叛和误解。他的好兄弟楚归鸿因为误会而与他反目成仇，处处与他作对。而女主角宋一梦，因为是穿书而来，认定南珩就是那个会黑化的大反派，对他充满了误解和敌意，甚至试图联合别人去刺杀他，这种友情的破裂和爱情的失落让南珩陷入了深深的绝望。
最后，在事业方面，南珩也遭遇了手下的背叛和坑害。他派上官鹤秘密寻找能看懂化学方程式的师父，结果这一信息被手下泄露，导致全城皆知。他的手下残江月团队也是管理不善，导致重要物品被盗，南珩不得不亲自出面解决这些棘手的问题。
