重庆洪崖洞附近商业街被淹的主要原因是该地区地势低洼且排水系统不完善。具体来说：
地势低洼：洪崖洞位于重庆市渝中区嘉陵江畔，地势相对较低，周边商业街的建筑也大多位于地面以下。这使得在遭遇强降雨时，地面上的积水很容易涌入这些低洼区域。
排水系统不完善：虽然近年来重庆市政府加大了对排水系统的投入和改造力度，但在极端天气条件下，现有的排水系统仍然难以满足快速排水的需求。地形复杂，地势高低起伏大，也给排水工作带来了不小的挑战。
为了避免这种情况的发生，除了加强排水系统的建设和改造外，市民和游客在暴雨天气下也应注意防范，尽量避免前往低洼区域，以确保人身安全。同时，政府和相关部门也需要加强预警和应急响应机制，及时采取有效措施应对暴雨天气，减少灾害损失。
