咸鸭蛋的保质期根据包装、保存条件以及生熟状态有所区别，范围在1周到12个月不等，若出现变质特征无论是否超期都不可食用。
真空包装市售咸鸭蛋：常温放置在阴凉干燥处可保存3~6个月，放入冰箱冷藏可延长保质期至6~12个月；夏季常温存放时保质期缩短，一般仅能保存3个月以内。
自制或散装咸鸭蛋：常温条件下可保存1~2个月，夏季高温环境下保质期大幅缩短，仅能保存1~2周；放入冰箱密封冷藏，可保存3~6个月。
熟咸鸭蛋：未开封的密封熟咸鸭蛋放入冰箱冷藏，可以保存1~2周；如果咸鸭蛋已经切开，需要在1~2天内吃完，避免滋生细菌；常温放置的熟咸鸭蛋，仅能保存1~3天。
需要注意的是，保存过程中如果发现咸鸭蛋蛋壳发霉、产生酸腐异味、蛋黄散黄变色，说明已经变质，无论是否在保质期内都禁止食用，防止引发肠胃不适等健康问题。日常建议根据食用量提前规划，尽量在保质期内吃完，储存时注意密封防潮，延长可食用时间。
