《藏海传》讲述了亲历满门覆灭之祸的大雍国钦天监监正之子稚奴，化名“藏海”重返京城，智斗奸佞、揭破阴谋并守卫国家的故事。具体剧情如下：
稚奴一家突遭变故，庄芦隐带人抓蒯铎（稚奴之父），逼其交出工地密道里拿走的宝贝。蒯铎拒不配合，官兵们杀死其徒弟们。庄芦隐以月奴（稚奴亲人）性命相威胁，后又杀死狗剩、月奴，蒯铎妻子也被瞿蛟杀害，蒯铎抢过杀手枪自杀而死，稚奴一夜之间成了孤儿。
藏海苦熬十年复仇，发现最大的仇人赵秉文竟是当年从火场救出自己的面具人。赵秉文暗中操控藏海人生，培养高明当眼线、误导他追杀错误仇人，连亲女儿八公子都成监视藏海的棋子。藏海查内阁首辅石一平是“第三人”时，对方突然毒发身亡，他觉出不对劲。辞官试探时，满朝文武只有赵秉文拼命挽留。八公子和香暗荼喝茶时漏了句“父亲书房有密道”，坐实藏海猜想。鸿门宴上，赵秉文撕破脸，藏海被扣上弑君罪名押入死牢。高明为助藏海假死脱身，甘愿喝下赵秉文的毒酒。
藏海想利用癸玺引出把他家灭门的第三个凶手，冒险进入皇宫含章殿偷出癸玺，却被时全和曹静贤抢走。明玉肃提和香暗荼及时赶来声援，双方激战，明玉肃提为救藏海和香暗荼中箭身亡。皇帝怀疑明玉肃提偷走癸玺，包围枕楼和质宫，藏海担心香暗荼被抓，高明劝他死心，藏海坚持去看香暗荼。香暗荼送走母亲后回到质宫被禁军包围，藏海断定枕楼搜出的信件是曹静贤搞的鬼，让高明伪造刑科驾帖进入大牢看香暗荼，后藏海决定找皇帝自首。
赵秉文殒命，高明自尽，藏海隐居。万奴王陵决战揭穿鬼玺惊天骗局，赵秉文举着发光玉玺狂笑，藏海一刀劈碎石壁，毒粉倾泻，香暗荼喊破真相，赵秉文抓香暗荼割腕血祭鬼玺，香暗荼用冬夏王族血脉启动封印，断龙石轰然砸落前把鬼玺永封墓中。
